2018年,南航获得 IATA 2017年度北亚区电子货运最佳航空公司奖

2017年,南航获得IATA 2016年度货运电子运单最佳发展奖

2016年，南航获得了“中国十大竞争力物流企业”、“中国品牌价值百强物流企业”和“中国物流十大经营创新奖”的荣誉。

2014、2015年，南航都获得了“中国物流业品牌价值百强”和“中国十佳物流企业”的荣誉。

2013年,南航在中国交通运输协会主办的2013年第十届中国国际物流节上获得“中国航空物流最佳企业”和“中国物流业品牌价值百强企业”的荣誉。

2012年9月5日，南航荣获亚太航空货运协会联合会(FAPAA)官方杂志《PAYLOAD ASIA》评选的“2012年度最佳组合型航空货运承运人”（即同时运营腹舱和货机的航空公司）称号。